由于热保护器配件有些增强子位于启动子上游，有些位于下游，所以热保护器配件的效应并不取决于热保护器配件同启动子的相对位置。因此，对热保护器配件效应的方向性的原因还没有真正弄清楚。目前已发现有两个基因座以反式活化方式影响热保护器配件的功能。基因S2J(Hw)编码的核蛋白识别热保护器配件，热保护器配件同其结合后才有绝缘作用。当该基因突变后，尽管y基因座中插入了热保护器配件，但失去了绝缘作用，y在所有组织中都表达。
另一个基因座是mod(mdg 4)，该基因发生突变后，其效应正好与Su(Hw)相反，即这些突变型都增强了绝缘作用，使热保护器配件的绝缘效应不再有方向性而得到扩展，也就是阻断了上游和下游两侧的增强子的效应。有一种解释认为先是Su(Hw)同热保护器配件DNA结合后，使热保护器配件有绝缘效应。mod(mdg4)同Su(Hw)结合，使热保护器配件失去绝缘效应；突变的mod(mdg4)不能同Su(Hw)结合，于是热保护器配件又增强了绝缘作用。
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