• 发布日期：2018-07-20
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深圳子科生物报道：单细胞测序技术填补了生命科学领域的许多空白，依靠这项技术，康涅狄格大学健康中心和杰克逊实验室（JAX）的研究人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞（retinal ganglion cells，RGCs）亚型，以及用于区分它们的遗传标记和转录因子。

得益于液滴单细胞RNA测序技术（droplet-based single-cell RNA sequencing），研究人员现在能单独分离每个细胞并扩增其遗传物质来探查RNA组成。这才允许科研人员对给定类型细胞（例如RGCs）进行详细普查，识别它们不同亚型之间的细微分子差异。

RGCs将视觉数据从眼睛传递给大脑，之前已经识别了30种RGCs亚型，利用单细胞RNA测序，研究小组分析了6225个来自新生小鼠左右眼的单个RGCs，检测到大约5000个表达基因，通过聚类算法运行所得数据，将细胞分类为40个子类型。

由神经科学系教授Ephraim F. Trakhtenberg博士领导的这项研究发表于《Nature Communications》，他们为生物学领域的一大类问题提供了新参考：细胞的亚型或类型由什么决定？

哺乳动物中枢神经系统高度复杂，涉及许多专门的神经元类型和亚型以及它们之间的相互作用。研究小组之所以选择调查RGCs，是因为与其他主要神经元类型相比，它们是迄今为止鉴定出最多亚型的一类细胞。并且，其他视网膜细胞类型（例如，光感受器）已经在单细胞水平上被广泛研究了。因此，研究人员希望测定RGCs亚型之间的分子差异，并找到它们的独特标记。

除了鉴定新RGC亚型和生物标记，研究人员还指出了将细胞分化为这些亚型所需的基因表达变异量，并提出了从细胞型群体到亚型群体的层次结构。目前，该研究公开数据可访问UConn Health网站“RGC Subtypes Gene Browser”免费获取。

原文检索：Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes